- 阿蘇野草園(あそやそうえん):高森町
- 菊池渓谷 野鳥の森の植物(きくちけいこくやちょうのもりのしょくぶつ):菊池市
- 河尻神宮のヒイラギ(かわしりじんじゃのひいらぎ):熊本市
- 森林総合研究所 九州支所(しんりんそうごうけんきゅうじょ):熊本市
- 榎津のエノキとムクノキ(えのきづのえのきとむくのき):熊本市
- 牛深のサソリモドキ(うしぶかのさそりもどき):天草市
- 松島のウミホタルと夜光虫(まつしまのうみほたるとやこうちゅう):上天草市
- 永浦島のハクセンシオマネキ(ながうらじまのはくせんしおまねき):上天草市
- 早崎海峡のイルカ(はやさきかいきょうのいるか):天草市
- 茂串の海生動物(もぐしのかいせいせいぶつ):天草市
- 球磨川水系のヤマメ(くまがわすいけいのやまめ):水上村
- 水島周辺の海岸動物(みずしましゅうへんのかいがんどうぶつ):八代市
- 菊池川の干潟の生き物(きくちがわのひがたのいきもの):玉名市
- 干潟のテナガダコ(ひがたのてながだこ):荒尾市
- 小原高柳のゲンジボタル(おばるたかやなぎのげんじぼたる):菊池市
- ヒメボタルと湯舟の堤(ひめぼたるとゆぶねのつつみ):菊池市
- 泗水町のオヤニラミ・メダカ(しすいまちのおやにらみ・めだか):菊池市
- 遊水峡のカジカガエル(ゆうすいきょうのかじかがえる):小国町
- 水越のゲンジボタル(みずこしのげんじぼたる):御船町
- 日平川のゲンジボタルとヘイケボタル(ひびらがわのげんじほたるとへいけほたる):和水町